模具制造企业目前遇到的问题主要还是加工效率问题，这是数控电火花加工的不足之一。比如汽车轮胎模具，除了要解决效率问题外，对于设备提供商来说，还要提高电源性能，针对不同产品材料提供不同的电火花加工参数库。目前国外进口的设备一般都具有良好的机械运动精度和丰富的工艺数据库，同时进口设备的故障率也很低、运行可靠。而国产数控电火花加工技术及设备与国外相比存在着明显的不足，工艺数据库的实用性有待进一步提高。对于用户来说，希望购买的设备能够适合于加工自己的产品，这就要求设备制造商必须通过大量的工艺试验来验证不同材料加工规准的一致性和可靠性。目前国内设备的工艺数据库比较单一，需要用户自行摸索和试验，加大了用户的使用难度。比如医疗器械产品大多都采用了钛合金等难加工轻质材料，国内的多轴联动精密数控电火花机床基本上还没有加工钛合金材料的数据库，而瑞士GF阿奇夏米尔公司的多轴联动电火花机床，就已经内置了加工钛合金材料的参数库，直接调用即可，大大降低了用户的使用要求，企业因此也可以省去大量试验所花费的时间、材料、人力等成本，直接投入生产即可。
随着现代科学技术的发展，数控电火花加工正朝着高速化和高精度化方向发展，同时也产生了许多复合型加工方法。比如电火花混粉加工、超声—微细电火花复合加工等，但是目前这类技术基本上都处于高效实验室研究阶段，市场上并没有成熟产品应用。尤其是微细电火花微孔加工、微三维结构加工等，研究成果基本上都是来自于各高校实验室，而国外已经有了非常成熟的机床型号推向市场，国内市场基本还是一片空白。
随着制造业技术的发展，一些零件需要多轴联动精密数控电火花加工来完成，但是国内目前还没有五轴及五轴以上的精密数控电火花机床正式投入市场，虽然现在国内已经有支持多轴联动的数控系统出现，但是其加工稳定性、系统可靠性还有待进一步考验。国外此类设备已经非常普及，瑞士、日本、德国等均有五轴联动精密数控电火花加工机床在市场上销售。
目前国内的数控电火花机床液槽均采用了侧开门方式，由于结构的原因，用户在使用时容易导致漏油污染地面。对于国内生产商来说，若能解决自动升降液槽的金属钣金及密封技术，对于提高我国数控电火花机床制造水平将是一个巨大的进步。