由于加工中心带有刀库并能自动更换刀具，能对工件各加工面自动地进行钻孔、锪孔、铰孔、镗孔、攻螺纹、铣削等多工序加工。所以数控加工程序编制中，从加工工序的确定，刀具的选择，加工路线的安排，到加工程序的编制，都比普通数控机床要复杂一些。加工中心编程的工艺处理要考虑以下几点：
1、加工内容选择 通常选择尺寸精度、位置精度要求较高的表面，不便于用普通机床加工的复杂曲线和曲面。能够集中加工的表面在加工中心上加工。
2、工艺路线制定 在加工中心上加工零件，由于零件加工的工序多，使用的刀具种类多，甚至在一次装夹下，要完成粗加工、半精加工与精加工。因此要周密合理地安排各工序的顺序，有利于提高加工精度和生产效率。在遵循“基面先行”、“先粗后精”及“先面后孔”一般工艺原则外，还应考虑减少换刀次数，节省辅助时间；每道工序尽量减少刀具的空行程，按最短路线安排加工表面的加工顺序；安排加工顺序时可参照粗铣大平面——粗镗孔、半精镗孔——立铣刀加工——加工中心孔——钻孔——攻螺纹——平面和孔精加工（精铣、铰、镗等）的加工顺序进行。
3、刀具预调 为提高机床利用率，尽量采用刀具机外预调，并将预调尺寸于运行程序前及时输入到数控系统中，以实现刀具补偿。