数控车床坐标系统分为机床坐标系和工件坐标系(编程坐标系)。无论哪种坐标系统都规定与车床主轴轴线平行的方向为z轴，且规定从卡盘中心至尾座顶尖中心的方向为正方向。在水平面内与车床主轴轴线垂直的方向为x轴，且规定刀具远离主轴旋转中心的方向为正方向。
1、机床坐标系
以机床原点为坐标原点建立起来的x，z轴直角坐标系，称为机床坐标系。机床坐标系是机床固有的坐标系，它是制造和调整机床的基础，也是设置工件坐标系的基础。机床坐标系在出厂前已经调整好，一般情况下，不允许用户随意变动。
机床原点为机床上的一个固定的点。车床的机床原点为主轴旋转中心与卡盘后的端面之交点。参考点也是机床上的一个固定点，该点是刀具退离到一个固定不变的极限点，其位置由机械挡块来确定。
2．工件坐标系(编程坐标系)
工件坐标系是编程时使用的坐标系，所以又称为编程坐标系。数控编程时，应该首先确定工件坐标系和工件原点。
零件在设计中有设计基准。在加工过程中有工艺基准，同时要尽量将工艺基准与设计基准统一，该基准点通常称为工件原点。
以工件原点为坐标原点建立的X、Z轴直角坐标系，称为工件坐标系。工件坐标系是人为设定的依据是符合图样要求，从理论上讲，工件原点选在任何位置都是可以的，但实际上，为了编程方便以及各尺寸较为直观，应尽量把工件原点的位置选得合理些。
3．工件坐标系设定
编程人员在确定起刀点的位置XOZ0后，还应通过G50坐标系设定指令(有的机床用G92指令)告诉系统，刀尖点相对于工件原点的位置，即设定一个工件坐标系。G50是一个非运动指令，只起预置寄存作用，一般作为第一条指令放在整个程序的前面。
其指令格式为G50 X(α) Z(β)；式中α、β分别为刀尖的起始点距工件原点在X向和Z向的尺寸。
执行G(50) X(α) Z(β)后，系统内部即对(α,β)进行记忆，并显示在显示器上，这就相当于在系统内部建立了一个以工件原点为坐标原点的工件坐标系。